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今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

xliang9550 / 2013-11-19 00:11
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今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

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晚上7点左右开始在Windows 7 Pro x64下执行,盯了半天任务管理器,感觉困了,趴在桌子上打了个盹,醒来的时候是8点30分,还没处理完,又等了10分钟,到8点40分,终于读出了结果。

心想还有3个类似的模型要处理,恐怕要耗到第二天天亮了,于是改变策略,重启,进入grub选单,选择Linux系统,同样是处理这些模型,等我把后三个模型处理完,是晚上9点15分。

比较一下耗时,1小时40分钟对30分钟……
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diyiliaoya 超级版主 志愿者 发表于 2013-11-19 10:57:00 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

不明觉厉

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kiscore 发表于 2013-11-19 11:20:02 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

楼主想说,linux跑了30分钟的东西,win7 64跑了1小时40分钟。 :D
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loveline123 发表于 2013-11-19 13:24:31 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

晚上7点左右开始在Windows 7 Pro x64下执行,盯了半天任务管理器,感觉困了,趴在桌子上打了个盹,醒来的时候是8点30分,还没处理完,又等了10分钟,到8点40分,终于读出了结果。

心想还有3个类似的模型要处理,恐怕要耗到第二天天亮了,于是改变策略,重启,进入grub选单,选择Linux系统,同样是处理这些模型,等我把后三个模型处理完,是晚上9点15分。

比较一下耗时,1小时40分钟对30分钟……
好牛 我都是算的小问题 几分钟就解决了

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xliang9550 发表于 2013-11-19 19:19:52 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

补充一下,昨晚是用Windows软件求解一个模型,耗时1小时40分钟。
然后在Linux下求解剩下的3个模型,总耗时30分钟。

今天尝试用Linux求解昨晚的第一个模型,用的是另一台低配的电脑,耗时25分钟。以下是对比:
Windows 7 Pro x64平台(2012年配置):酷睿i7 3770,32GB内存,240GB固态硬盘。耗时1小时40分钟。
Ubuntu 12.04 LTS x64平台(2008年配置):酷睿2 Q9300,4GB内存,160GB机械硬盘。耗时25分钟。

考虑硬件配置上的巨大差异,可以保守估计Linux平台的执行效率是Windows平台的10~20倍。看来我们实验室选择购买Linux版的授权许可是十分具有先见之明的……
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BingoLove 发表于 2013-11-19 19:27:32 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

补充一下,昨晚是用Windows软件求解一个模型,耗时1小时40分钟。
然后在Linux下求解剩下的3个模型,总耗时30分钟。

今天尝试用Linux求解昨晚的第一个模型,用的是另一台低配的电脑,耗时25分钟。以下是对比:
Windows 7 Pro x64平台(2012年配置):酷睿i7 3770,32GB内存,240GB固态硬盘。耗时1小时40分钟。
Ubuntu 12.04 LTS x64平台(2008年配置):酷睿2 Q9300,4GB内存,160GB机械硬盘。耗时25分钟。

考虑硬件配置上的巨大差异,可以保守估计Linux平台的执行效率是Windows平台的10~20倍。看来我们实验室选择购买Linux版的授权许可是十分具有先见之明的……

做计算基本都是Linux平台,Windows平台最多就是画下图,做简单的计算,

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xliang9550 发表于 2013-11-19 19:55:56 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

在Linux下画图也没压力,我的主力工作站的Intel HD4000核芯显卡支持很好。
关于计算的执行效率,我原以为最多差个50%到头了,结果……
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woodelf 发表于 2013-11-19 21:21:53 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

LZ又开始有些极端了。
操作系统负责什么?
1、提供与底层硬件的交互和控制。
2、为上层软件提供运行平台和基础支持。
我注意到你说的是用某软件来实现运算,而不是操作系统内置的某项函数或功能。
因此站在我的角度来看,完全无法排除软件本身的优化问题和设置问题。
如果使用操作系统本身的函数或功能来实现的运算,才会更有说服力。

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xliang9550 发表于 2013-11-20 10:04:57 | 显示全部楼层

Re: 今晚用Windows和Linux分别处理相同的分子轨道能级图模型,这个结果碉堡了……

具体一点,我用的是Gaussian 09/W和GaussView,使用相同的CPU内核以及内存空间。计算的精度设置是完全相同的,例如迭代求解自洽场方程组以及单、双电子积分的一、二阶偏微分的收敛精度。

关于软件针对系统的优化,这个版本是针对SSE4.x优化的,而我运行Linux的低配机器还不支持这个指令集,所以Windows平台的优势是全方面的。
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